出版社の方から修正依頼。偶数ページの左上に表示される short title は一行で書く必要があるらしい。しかし初期状態では、title と short title は連動しており、short title のために title の方を編集すると見た目が崩れてしまう事がある。色々試した結果、renewcommand を使って shorttitle コマンドを書き換えれば実現できるみたいです。
matplotlibで作ったグラフ（PDF）の文字が埋め込まれてないので、埋め込む or フォントを変更して欲しいと出版社から連絡があった。Type3 フォントやTrue Type Fonts など見慣れない用語が出てきたので対策をメモ。